lncRNA功能預(yù)測
產(chǎn)品別名 |
lncRNA功能預(yù)測 |
面向地區(qū) |
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lncRNA是當(dāng)前生物醫(yī)學(xué)的熱門研究領(lǐng)域，但是由于其作用方式多樣，作用位點復(fù)雜，如果通過常規(guī)的實驗進(jìn)行驗證往往費時費力，而且還存在較多變數(shù)，是目前非編碼RNA研究中的主要難點所在。目前l(fā)ncRNA的功能主要通過和特定的蛋白質(zhì)/DNA/RNA進(jìn)行相互結(jié)合，發(fā)揮對靶基因的調(diào)控作用。因此，對目標(biāo)lncRNA的功能預(yù)測，將大大減少我們的科研工作量，提高實驗的成功率，為發(fā)現(xiàn)目標(biāo)分子的功能研究奠定堅實的基礎(chǔ)。
如果兩個分子存在相互作用，那么二者在表達(dá)上往往具有某種關(guān)聯(lián)，基于這個原理因此，我們開發(fā)了lncRNA（包括mRNA）共表達(dá)分析技術(shù)，應(yīng)用于目標(biāo)分子的功能預(yù)測。本技術(shù)利用不斷更新的海量數(shù)據(jù)庫（目前已經(jīng)包括6萬張Affymetrix 表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)及5000套TCGA數(shù)據(jù)），建立共表達(dá)分析流程，預(yù)測功能相關(guān)基因，并建立功能分類網(wǎng)絡(luò)、信號通路、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)，通過對數(shù)據(jù)的深入挖掘，可獲得相關(guān)的重要蛋白及其功能和所在通路，以指導(dǎo)下一步的 lncRNA 功能驗證。
本服務(wù)項目提供分析結(jié)果包括：
1、表一.xls：與目標(biāo)lncRNA/mRNA 具有正向和反向共表達(dá)關(guān)系的基因各500個；
2、表二.xls：共表達(dá)基因功能分類網(wǎng)絡(luò)
3、表三.xls：共表達(dá)基因信號通路網(wǎng)絡(luò)
4、圖一.jpg：蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
5、表四.xls：網(wǎng)絡(luò)元素權(quán)重分析
6、完整分析報告.pdf：包括功能預(yù)測、靶點基因、正負(fù)調(diào)控關(guān)系及相關(guān)文獻(xiàn)查詢結(jié)果分析。
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