超級增強子鑒定服務(wù)
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超級增強子鑒定服務(wù) |
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超級增強子 (Super Enhancer, SE) 為8 ~ 20 kb具有轉(zhuǎn)錄增強活性的超長順式作用元件，可富集高密度的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子(master transcription factors)、輔因子(cofactor)和增強子表觀修飾標記(histone modification marks)，并激活細胞中身份決定基因的表達，發(fā)揮調(diào)控細胞命運的關(guān)鍵作用，還能促進關(guān)鍵致癌基因表達，富集疾病相關(guān)變異，具有重大研究價值，已經(jīng)成為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究熱點。
醫(yī)學(xué)研究意義
1. 發(fā)現(xiàn)致病驅(qū)動基因
2. 分析疾病關(guān)聯(lián)變異位點易感性
3. 開發(fā)基于SEs復(fù)雜性疾病的診斷和藥物開發(fā)
超級增強子鑒定流程
測序流程
樣本類型：細胞/組織
細胞數(shù)量：10*107
樣本處理：甲醛交聯(lián)
使用抗體：anti-H3K27ac/ anti-BRD4/ anti-P300
分析結(jié)果示例
1、 普通增強子與超級增強子鑒定分析
2、 普通增強子與超級增強子差異（長度及數(shù)目）分析
3、 超級增強子鑒定及數(shù)量分析圖繪制
4、 普通增強子與超級增強子信號富集圖繪制
5、 超級增強子的注釋及調(diào)控靶基因預(yù)測
6、 超級增強子調(diào)控靶基因KEGG、GO分析
7、超級增強子結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測
超級增強子整體課題研究策略
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